Endonukleasen sind Enzyme, die brechen DNA in kleinere Fragmente, indem die Phosphodiesterbindung innerhalb einer Polynukleotidkette gespalten wird. Sehen wir uns einige seiner Beispiele an.
- RecBCD-Endonuklease
- T7-Endonuklease
- T4-Endonuklease II
- Bal 31-Endonuklease
- Endonuklease I
- Mikrokokken-Nuklease
- Endonuklease II
- S1 Nuklease
- P1-Nuklease
- Mungobohnen-Nuklease I
- DNase I Enzym (P00639)
- AP-Endonuklease
- BamHI
- EcoRI
- EcoRV
- HindIII
- HaeIII
RecBCD-Endonuklease
RecBCD Endonuklease ist produziert in E. coli Zelle. Es ist teilweise ATP-abhängig und arbeitet in Rekombination und Reparatur. Das RecBCD-Enzym führt die Doppelrollen einer Nuklease und einer Helikase, die die DNA-Stränge entleert oder trennt und einzelsträngige Kerben in der DNA erzeugt.
T7-Endonuklease (P00641)
Phage T7 (Gen 3) ist die Quelle von T7-Endonuklease-Enzym. Replikation erfordert DNA mit einer Neigung zu Einzelsträngen gegenüber Doppelsträngen. Ein Enzym, das besonders an und bindet spaltet vierfache (Holliday) DNA-Verbindungen nach viraler genomischer Replikation, um Verbindungen aufzulösen.
T4-Endonuklease II (P07059)
Phage T4 (denA) ist die Quelle von T4-Endonuklease II. Die von diesem Enzym produzierten Oligonukleotide mit 5'-dCMP-Ende werden von der -TpC-Sequenz abgespalten; Die Länge der Produktkette variiert je nach Situation. Hilfsmittel im Abbau der Wirts-DNA, ermöglicht die Bildung von Phagen-DNA durch Abfangen von Nukleotiden aus dem Wirt.
Bal 31-Endonuklease
P. espejiana ist die Quelle von Bal 31-Endonuklease . Außerdem werden die 3'- und 5'-Enden der Duplex-DNA durch diese Endonuklease verändert. Mindestens zwei Nukleasen, kombiniert mit schnellen und langsamen Enzymen.
Endonuklease I (endo I; P25736)
E. coli (EndeA) ist die Quelle von Endonuklease I. Endo I-Mutanten entwickeln sich weiterhin ordnungsgemäß, obwohl sie sich im Periplasma befinden und eine durchschnittliche Kettenlänge von sieben aufweisen, würden dadurch gehemmt tRNAverursacht doppelsträngige DNA-Addukteund Nicks erzeugen, wenn sie mit tRNA komplexiert werden.
Mikrokokken-Nuklease (P00644)
Staphylococcus ist die Quelle von Mikrokokken-Nuklease. Erzeugt 3′-P-Termini, bevorzugt einzelsträngige DNA und AT-reiche Regionen, benötigt Kalzium und beeinflusst RNA. Ein Enzym, das die 5′-Phosphodiesterbindungen sowohl in DNA als auch in RNA auflöst.
Endonuklease II (Endo VI, Exo III; P09030)
Coli (xthA) ist die Quelle von Endonuclease II. In der Nähe der Spaltstelle befindet sich auch ein 3′–>5′ Exonuklease, und die 3'-P-Termini haben Phosphomonoesterase. Das primäre RE in E. coli ist Apurin-Apyrimidin-Endonuklease.
S1 Nuklease (P24021)
Aspergillus oryzae ist die Quelle. Auch die RNA ist betroffen. Baut nur einzelsträngige DNA und RNA ab; keine offensichtliche Präferenz für Basen. Die Endprodukte der endonukleolytischen Spaltung sind 5'-Phosphomononukleotid und 5'-Phosphooligonukleotid.
P1-Nuklease (P24289)
Penicillium citrinum ist die Quelle. Auch die RNA ist betroffen. Baut nur einzelsträngige DNA und RNA ab; keine offensichtliche Präferenz für Basen. Endprodukte, die durch endonukleolytische Spaltung hergestellt werden, schließen ein 5'-Phosphomononukleotid und 5'-Phosphooligonukleotid.
Mungobohnen-Nuklease I
Mungobohnensprossen ist die Quelle. Auch die RNA ist betroffen. Doppelsträngige DNA, DNA/RNA-Hybride oder doppelsträngige RNA werden jedoch nicht durch das Enzym abgebaut. Es nur produziert Nukleosid-5′-Monophosphate wenn einzelsträngige DNA oder RNA abgebaut wird.
DNase I Enzym (P00639)
Bauchspeicheldrüse vom Rind ist die Quelle. Das Produkt hat im Durchschnitt eine viergliedrige Kette und Mn2+ führt zu einem Doppelstrangbruch. Serum-Endonuklease wird von zahlreichen produziert exokrine und endokrinen Organen und kommt in Körperflüssigkeiten vor.
AP-Endonuklease
Zellkern und Mitochondrien sind die Quellen. Es handelt sich um den DNA-Basenexzisions-Reparaturweg. Die DNA-BER verwendet das AP-Endonuklease-Enzym (Base Excision Repair Pathway).
BamHI
BamHI, eine Typ-II-Restriktionsendonuclease, erzeugt durch Bacillus amyloliquefaciens, kann kurze (6 bp) DNA-Sequenzen erkennen und Schneiden Sie sie genau an einer Zielstelle.
ECORI
ECORI ist ein Restriktionsendonuclease-Enzym das ist eine Komponente des Beschränkungsänderungssystems und baut DNA-Doppelhelices ab an bestimmten Stellen in Fragmente.
ECORV
ECORV ist eine Restriktionsendonuclease vom Typ II das hört sich so an ECO32I. Es wird ausgiebig genutzt Restriktionsenzym in der Molekularbiologie.
HindIII
Das ortsspezifische Deoxyribonuklease-Restriktionsenzym von Haemophilus influenzae Typ II hydrolysiert den Cofaktor Mg2+ um die palindromische DNA-Sequenz AAGCTT zu brechen.
suchenIII
suchenIII ist eine Endonuklease die Organismen vor nicht identifizierter, externer DNA schützt. Es wird in molekularbiologischen Labors eingesetzt. Es war die dritte Endonuklease, die in den Bakterien entdeckt wurde Hämophilus aegyptius.
Fazit
Enzyme, die Endonukleasen genannt werden, spalten die Phosphodiesterbindung, die in Polynukleotidketten gefunden wird. Während viele DNA-schneidende Enzyme an extrem spezifischen Nukleotidsequenzen spalten, brechen andere, wie z. B. Desoxyribonuklease I, DNA etwas zufällig (ohne Rücksicht auf die Sequenz).
